Могу предположить что ноги не готовы к спускам и подъемам. Стадион всё-таки равнина. Так же на асфальте больше ударная нагрузка на суставы, чем на мягкой дорожке.

@Станислав  Малюшицкий, подпишусь под фразой о спусках и подъемах. Сам планирую перед следующим марафоном отдельно тренировать эти элементы. Все же Москва - город на семи холмах, это не Амстердам, например.

потма, нужно mmr поднять до 6к, что бы не болели.

Недостаточный тренировочный объем.

Если ломило колени и болела передняя часть бедра, то это скорее всего исправляется бегом по горкам и ускорениями в холм.

Скорее всего недостаточно укреплены ноги в том числе. Приседания, выпрыгивания, статика в помощь. И горки как уже советовали

Тренировать необходимо в основном на асфальте. Трехчасовые пробежки ни к чему, ну только если очень хочется.

Владимир, какой у Вас вес?
Какой был ежемесячный объем в каждый из двух месяцев подготовки?
Как близко к старту пробежали последнюю длительную?
Сколько всего было длительных за два месяца (длиннее 2,5 часов)?

Про горки уже рассказали. Причем не только вверх, но и вниз . Убитыми ногами крайне сложно сбегать. В полной мере московские марафонцы должны были это ощутить спускаясь по Китаю а набережную. Научитесь "стряхивать "ноги

@Владимир  Метелкин, 68кг и 185 рост.
Июль ~160км
Август ~180км
Начало сентября один крупный забег, дальше плавная разгрузка до полных выходных.
Последний длительный забег к старту был ~15-17 дней до старта.
Всего длительных было более 2.5 часов был

@Владимир  Филимонов, а что бежали за 15 дней до старта?
Объемы маловаты - ноги долго восстанавливаются после длительных.

@Владимир  Метелкин, такая же рядовая длительная тренировка по стадиону с чередованием по асфальту.