Разумно определяться с принципами подготовки той или иной школы, исходя из индивидуальных предрасположенностей.

Силовая работа на мышцы ног наиболее актуальна в базовом периоде, в дальнейшем она будет здорово мешать восстановлению, закрепощая мышцы, а значит, снижая скорость восстановления. Поэтому пока вбегиваетесь, приучая организм к бегу на открытом воздухе, пару раз в неделю совершать походы в зал возможно. Делая следующий день свободным от бега!

Как только начнете поднимать объемы к 40 км в неделю, зал придется сократить - одну тренировку можно по-прежнему делать развивающей (более трех подходов), а вот вторую, если останутся силы, стоит сделать чисто номинатьной - один подход по основным тренажерам в круговую. Понятно, что развивать силу Вы уже не сможете - будете поддерживать то, что есть.

За пару месяцев до старта, когда пойдут основные объемы (60 км в неделю и более!), придется оставить только одну тренировку, все остальное - по возможности и остаточному принципу.

А когда пойдет пора подводиться к старту сбрасывая объемы (не менее, чем за пару недель!), с силовой работой в зале придется завязать!
Вернуться с силовым тренировкам стоит уже после финиша, ускоряя тем самым восстановление.

По поводу групп. В первую очередь это сгибатели бедра - подвздошно-поясничная мышца (подъем колена) и икроножная мышца! По мере возможности можно поработать над сгибателем голени (бицепс бедра) и приводящей (медиальной) мышцей бедра.
Отдельно стоит уделить внимание мышцам пресса и спины - в первую очередь поясницы.
Квадрицепс качать не стоит - он и так развит предостаточно! Ягодичную мышца тоже в принципе достаточно развита, но т.к. она тоже участвует в продвижении тела вперед, то можно, при желании, работать над ней в конце тренировки.